Table 4 Number (percentage) of isolates showing similar ERIC-PCR and VAGs patterns
From: Pathogenicity assessment of Arcobacter butzleri isolated from Canadian agricultural surface water
Sampling sites | Similar ERIC-PCR pattern | Number of VAG positive isolates (%) | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
ciaB | cj1349 | tlyA | mviN | hecB | pldA | irgA | hecA | ||
1 | 52a | 41 (79) | 3 (6) | 38 (73) | 20 (38) | 5 (10) | 17 (33) | 2 (4) | 3 (6) |
5 | 132 | 115 (87) | 11 (8) | 103 (78) | 98 (74) | 11 (8) | 71 (54) | 7 (5) | 9 (7) |
6 | 80 | 77 (96) | 6 (8) | 68 (85) | 65 (81) | 4 (5) | 59 (74) | 1 (1) | 0 (0) |
9 | 140 | 122 (87) | 21 (15) | 131 (94) | 105 (75) | 11 (8) | 98 (70) | 5 (4) | 7 (5) |
15 | 76 | 51 (67) | 2 (3) | 49 (64) | 44 (58) | 3 (4) | 33 (43) | 0 (0) | 2 (3) |
17 | 0 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
18 | 0 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
19 | 2 | 2 (100) | 0 (0) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) |
20 | 2 | 2 (100) | 0 (0) | 2 (100) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
22 | 0 | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |
23 | 2 | 2 (100) | 0 (0) | 2 (100) | 1 (50) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) | 0 (0) |