Table 1 Reference strains tested by MALDI-TOF MS analysis. The two best matches obtained in the Biotyper were taken into account. For strains for which the first and second best match indicated the same species, only one result (with the highest log(score)) is shown in the table. A-U – symbols for reference strains used in Table 3 and in Figs. 1, 2, 3 and 4
No. | Reference strains | MALDI-TOF MS | Biotyper log(score) | |
|---|---|---|---|---|
| Â | Species | Strain number | ||
1 | L. acidophilus (F) | ATCC 4356 | L. acidophilus | 2.296 |
2 | L. agilis (C) | LMG 9186 | L. agilis | 2.321 |
3 | L. amylovorus (J) | LMG 9496 | L. amylovorus | 2.351 |
4 | L. casei (M) | ATCC 393 | L. zeae | 1.954 |
L. casei | 1.84 | |||
5 | L. crispatus (I) | LMG 9479 | L. crispatus | 2.117 |
6 | L. farciminis (E) | LMG 9189 | L. farciminis | 1.982 |
7 | L. gallinarum (L) | LMG 9435 | L. gallinarum | 2.179 |
L. acidophilus | 1.965 | |||
8 | L. gasseri (G) | ATCC 19992 | L. gasseri | 2.316 |
9 | L. ingluviei (R1) | LMG 20380 | L. ingluviei | 1.957 |
10 | L. ingluviei (R2) | LMG 22056 | L. ingluviei | 1.881 |
11 | L. johnsonii (H) | LMG 9436 | L. johnsonii | 1.994 |
L. gasseri | 1.897 | |||
12 | L. kitasatonis (K) | LMG 23133 | L. kitasatonis | 2.078 |
L. amylovorus | 1.953 | |||
13 | L. mucosae (S) | LMG 19534 | L. mucosae | 2.023 |
14 | L. oris (U) | LMG 9848 | L. oris | 1.949 |
L. antri | 1.79 | |||
15 | L. plantarum (D) | ATCC 8014 | L. plantarum | 2.002 |
16 | L. paracasei (P) | ATCC BAA-52 | L. paracasei | 2.133 |
17 | L. reuteri (T1) | LMG 9213 | L. reuteri | 2.192 |
18 | L. reuteri (T2) | LMG 18238 | L. reuteri | 1.971 |
19 | L. rhamnosus (N) | ATCC 7469 | L. rhamnosus | 2.324 |
20 | L. saerimneri (B) | LMG 22875 | L. saerimneri | 2.249 |
21 | L. salivarius (A1) | LMG 9476 | L. salivarius | 2.224 |
22 | L. salivarius (A2) | LMG 9477 | L. salivarius | 2.342 |
23 | L. zeae (O) | LMG 17315 | L. casei | 2.021 |
L. zeae | 2.007 | |||