Table 1 Sources of pathogens used and GeXP assay results
Pathogen/field samples | Number of samples | Source | Results | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
AIV- M | AIV- H5 | AIV- H7 | AIV- H9 | DHV | DEV | DTMUV | NDV | EDSV | MDRV | MDPV | DuCV | |||
Reference sample | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
acDNA of H5N3 AIV Duck/HK 313/78 | 1 | HKU | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
aH7N2 AIV Duck/HK/ 47/76 | 1 | HKU | + | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
aH9N6 AIV Duck/HK/147/77 | 1 | HKU | + | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
bDHV (AV2111) | 1 | CIVDC | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − | − |
cDEV (AV1221) | 1 | CIVDC | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − | − |
dDTMUV (GX201301,GX201302) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − | − |
eNDV (GX1/00,GX6/02) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − | − |
fEDSV (GEV) | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − | − |
gMDRV (NM1,NM2) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + | − | − |
hMDPV (GX-5,GX-6) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + |  |
iDuCV (GX1006,GX1008) | 2 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | + |
Other pathogens | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
H1N3 AIVDuck/HK/717/79-d1 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H1N1 AIV Human/NJ/8/76 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H2N3 AIV Duck/HK/77/76 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H3N6 AIV Duck/HK/526/79/2B | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H4N5 AIV Duck/HK/668/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H6N8 AIV Duck/HK/531/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H8N4AIV Turkey/ont/6118/68 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H10N3 AIV Duck/HK/876/80 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H11N3 AIV Duck/HK/661/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H12N5 AIV Duck/HK/862/80 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
H6N8 AIV Duck/HK/531/79 | 1 | HKU | + | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
duck Escherichia coli | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
duck Salmonella | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
duck Staphylococcus aureus | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
Pasteurella multocida | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
Infectious bronchitis virus | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
Mycoplasma gallisepticum | 1 | GVRI | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − | − |
Sample mixture | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â | Â |
AIV-H5 + AIV−H7 + AIV−H9 | 1 | GVRI | + | + | + | + | − | − | − | − | − | − | − | − |
AIV−H5 + DEV + DTMUV + NDV + EDSV | 1 | GVRI | + | + | − | − | − | + | + | + | + | − | − | − |
AIV−H5 + AIV−H7 + AIV−H9 + DHV + DEV + DTMUV + NDV + EDSV+ MDRV+ MDPV+ DuCV | 1 | GVRI | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + | + |