Forward primer (position 1006–1025) | 5' |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3' |
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A. vaginae | Â | G | G | T | G | A | A | G | C | A | G | T | G | G | A | A | A | C | A | C | T | Â |
A. fossor | Â | . | . | . | . | . | . | . | . | G | . | C | . | . | . | . | . | . | G | T | C | Â |
A. minutum | Â | . | . | . | . | . | . | . | . | G | . | C | . | . | . | . | . | . | G | T | C | Â |
A. parvulum | Â | . | . | . | . | . | . | . | . | G | . | C | . | . | . | . | . | . | G | T | C | Â |
A. rimae | Â | . | . | . | . | . | . | . | . | G | . | C | . | . | . | . | . | . | G | T | C | Â |
Reverse primer (position 1282–1265) | 5' |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  |  | 3' |  |
A. vaginae | Â | A | T | T | C | G | C | T | T | C | T | G | C | T | C | G | C | G | C | A | Â | Â |
A. fossor | Â | . | . | . | G | . | . | . | . | A | C | T | T | . | . | . | . | A | A | G | Â | Â |
A. minutum | Â | . | . | . | G | . | . | . | . | A | C | T | T | . | . | . | . | A | A | G | Â | Â |
A. parvulum | Â | . | . | . | . | . | . | . | C | A | C | C | . | . | . | . | . | . | G | G | Â | Â |
A. rimae | Â | . | . | . | . | . | . | . | C | G | C | C | . | . | T | . | . | . | G | G | Â | Â |