From: Screening of Lactobacillus spp. for the prevention of Pseudomonas aeruginosa pulmonary infections
Strain | Mass spectrometry | 16S RNA gene sequencing | rpoA gene sequencing | API 50 CHL | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Identification | Score* | Identification | NCBI accession number (GenBank) | Identification | NCBI accession number (GenBank) | Identification | Score | |
ES.A.2 | L. fermentum | 1.916 | L. fermentum | [KC762296] | L. fermentum | [KC861367] | L. fermentum | 96.3% |
ES.D.88 | L. paracasei | 2.458 | L. casei group | [KC762297] | L. paracasei | [KC861369] | L. paracasei | 98.4% |
ES.F.115 | L. fermentum | 2.21 | L. fermentum | [KC762298] | L. fermentum | [KC861368] | L. fermentum | 98.5% |
Od.76*** | L. zeae | 2.089 | L. casei group | [KC762299] | L. zeae/casei | [KC861370] | - ** | - ** |
L. casei | 2.043 | |||||||
K.C6.3.1D | L. fermentum | 2.18 | L. fermentum | [KC762300] | L. fermentum | [KC861371] | L. fermentum | 99.7% |
K.C6.3.1E | L. fermentum | 2.109 | L. fermentum | [KC762301] | L. fermentum | [KC861372] | L. fermentum | 99.7% |
K.V9.3.2B | L. fermentum | 2.163 | L. fermentum | [KC762302] | L. fermentum | [KC861373] | L. fermentum | 99.7% |
K.V9.3.2C | L. fermentum | 2.223 | L. fermentum | [KC762303] | L. fermentum | [KC861374] | L. fermentum | 99.8% |