Assessment of bacterial diversity during composting of agricultural byproducts

Chandna, Piyush; Nain, Lata; Singh, Surender; Kuhad, Ramesh Chander

doi:10.1186/1471-2180-13-99

BMC Microbiology

Table 3 Biochemical profiling of a bacteria: + = positive, - = negative, ± = variable, R= rods, C= cocci

From: Assessment of bacterial diversity during composting of agricultural byproducts

Laboratory no./ Designation	J	8	30	G	PQ	A	38	14	31 (a)	BC	red	H	17	actin 6	3	QR	B	M	D	14	26	X	32	Y	21	N	IN	Q	actin 5	actin 2	actin 1	‘31’ and ‘l’ data not shown
Morphology	+ C	+ R	+ R	+ C	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ C	- R	- R	-R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ C	+ R	+ R	- R	+ R	- R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R
Motility	-	-	+	-	+	+	+	+	+	-	-	-	-	+	-	-	-	+	-	+	+	-	-	-	+	+	-	+	-	-	-
Methyl red	-	-	-	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	±	+	-	-	-			+		-	-	-
Voges-Proskauer	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Citrate	+	-	±	+	-	+	-	-	+	-	+	+	+	-	-	+	+	+	+	-	±	+	+	-	±	-	+	-	±	+	±
Indole	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	±	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Morphology	+ C	+ R	+ R	+ C	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ C	- R	- R	-R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ C	+ R	+ R	- R	+ R	- R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R	+ R
Motility	-	-	+	-	+	+	+	+	+	-	-	-	-	+	-	-	-	+	-	+	+	-	-	-	+	+	-	+	-	-	-
Methyl red	-	-	-	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	±	+	-	-	-			+		-	-	-
Voges-Proskauer	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Citrate	+	-	±	+	-	+	-	-	+	-	+	+	+	-	-	+	+	+	+	-	±	+	+	-	±	-	+	-	±	+	±
Indole	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	±	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Glucornidase	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	±	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-
Nitrate reduction	+	-	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+	-	+	+	-	+	+	-	+	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+
Lysine decarboxylase	+	+	-	-	-	-	-	-	-	+	+	+	+	-	-	+	+	+	+	-	+	+	+	±	-	-	+		-	+	+
Lactose	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	+	-	-	+	-	-	±	-	-	+	±	-	±	-	+	-	-	-	-	-
Glucose	+	-	+	+	+	+	-	-	-	+	+	+	+	-	+	+	-	+	-	-	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Sucrose	+	+	+	+	+	+	-	-	-	+	+	+	+	-	+	+	-	+	+	-	+	+	+	+	-	-	+	+	+	+	+
Sorbitol	+	-	+	+	+	+	-	-	-	+	±	+	-	-	+	-	-	+	-	+	+	±	-	+	-	+	+	-	-	-	-
Ornithine decarboxylase	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	+	+	-	-	+	+	+	-	-	+	+	+	-	-	-	+	-	-	+	+
Urease	+	-	-	+	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Deamination	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
H₂S production	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
ONPG	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	+	+	-	-	-	-	-	+	-	+	-	+	-	-	-	-	-	-	+	-
Xylose	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Maltose	+	-	-	+	+	-	-	+	+	+	-	+	-	-	+	+	-	+	-	-	+	+	+	+	+	-	-	-	-	+	+
Fructose	+	-	+	+	+	+	-	-	-	+	-	+	-	-	+	+	-	+	+	-	+	+	+	+	-	-	+	+	+	+	+
Dextrose	+	-	+	+	+	+	-	-	-	+	+	+	-	-	+	+	-	+	-	-	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+
Galactose	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	-	+	+	+	-	+	-	+	+	+	+	+	+	+	-	+	-	-	-
Raffinose	-	+	-	-	+	+	+	+	±	+	-	+	-	+	+	-	-	+	-	+	+	-	+	-	+	+	-	+	-	-	-
Trehalose	+	+	+	+	-	-	-	-	-	+	-	+	-	+	+	+	-	+	-	-	+	+	+	+	-	-	+	-	+	-	+
Mellibiose	-	+	-	-	-	-	-	-	-	+	-	+	-	+	+	-	-	+	-	+	+	+	+	-	+	-	-	-	-	-	-
L-Arabinose	+	-	+	+	-	-	-	-	+	-	-	+	+	+	+	+	-	-	+	+	+	-	-	+	-	-	-	-	+	+	-
D-Arabinose	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	+	-	-	-	-	-	+	+	-	-	+	+	+	-	+	-	+
Inulin	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Sodium gluconate	-	-	-	-	-	+	+	+	-	-	-	-	-	+	+	-	-	-	-	-	+	-	-	+	+	-	-	-	-	-	-
Glycerol	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	+	-	+	+	-	-	+	-	+	+	+	+	-	-	+	-	-	-	-
Salicin	+	-	+	-	+	-	+	-	+	-	-	-	-	+	+	-	-	-	+	+	-	-	-	+	+	-	+	-	-	-	-
Glucosamine	-	-	+	+	+	+	+	+	-	-	+	-	-	+	+	+	-	-	-	+	-	-	-	+	+	+	-	±	-	-	-
Dulcitol	-	-	-	-	+	-	+	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	+	-	-	+	-	-	-
Inositol	-	-	+	-	+	-	-	+	-	+	-	+	-	+	-	+	-	+	-	-	-	+	-	+	+	+	-	-	-	-	-
Mannitol	+	-	-	+	+	-	-	+	-	+	+	+	-	-	+	+	-	-	+	-	+	+	+	+	-	+	-	+	-	-	-
Adonitol	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	±	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	-	-	-	-	-
α-methyl-D-glucoside	-	-	-	-	-	-	+	+	-	+	-	-	-	-	+	-	-	-	-	+	-	-	+	-	+	+	-	-	-	-	-
Ribose	+	-	+	+	+	+	+	+	+	+	+	+	-	+	-	-	-	-	-	+	+	+	+	+	-	-	+	-	-	-	-
Rhamnose	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	+	-	+	+	+	-	-	-	+	-	-	-	+	-	+	+	+	-	-	-
Cellobiose	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	-	-	-	-	±	-	-	-	-	-	-	-
Melezitose	+	-	+	-	+	-	+	-	+	+	-	-	-	+	+	-	-	-	-	+	-	-	-	+	+	+	-	+	-	-	-
α-methyl- D-mannoside	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	+	-	+	-	-	-
Xylitol	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Aesculin hydrolysis	-	+	+	-	+	-	-	-	-	-	+	+	+	+	-	+	+	-	+	-	+	-	-	-	+	-	+	-	+	+	-
Malonate	+	-	+	+	+	+	-	-	-	+	-	+	-	+	-	-	+	+	-	+	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-
Sorbose	-	-	-	-	-	-	-	+	-	+	-	-	-	+	-	-	-	-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-	-
Mannose	-	-	+	-	-	-	-	-	-	-	+	+	-	+	+	+	-	+	-	-	+	+	-	+	+	-	+	-	+	+	-
Propable organism	Staphylococcus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Staphylococcus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Staphylococcus sp.	Serratia sp.	Klebsiella sp.	Enterobacter sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Microbacterium sp.	Bacillus sp.	Kocuria sp.	Terribacillus sp.	Bacillus sp.	Acidovorax sp.	Bacillus sp.	Comamonas sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.	Bacillus sp.

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ISSN: 1471-2180

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