rpo B RFLP pattern | hsp65 RFLP pattern | 16 S rDNA sequence identification | Conventional biochemical | BACTEC culture number | Concordance rate |
---|---|---|---|---|---|
 |  |  | identification |  |  |
T | M. tuberculosis type 1 | M. tuberculosis | M. tuberculosis | 200 | 100%(200/200) |
 | NTM | NTM | NTM | 161 | 91.4%(161/176) |
A | M. abscessus type1 | M. abscessus | M. abscessus | 29 | Â |
A | M. abscessus type 2 | M. abscessus | M. abscessus | 41 | Â |
A | M. fortuitum type 1 | M. fortuitum | M. fortuitum | 33 | Â |
A | M. fortuitum type 2 | M. fortuitum | M. fortuitum | 2 | Â |
A | M. peregrinum type 1 | M. peregrinum | M. fortuitum* | 5 | Â |
A | M. peregrinum type 2 | M. peregrinum | M. fortuitum* | 8 | Â |
A | M. peregrinum type 3 | M. peregrinum | M. fortuitum* | 1 | Â |
A | M. chelonae type 1 | M. chelonae | M. chelonae | 1 | Â |
A | M. mucogenicum type 1 | M. mucogenicum | M. mucogenicum | 2 | Â |
A | M. smegmatis type 1 | M. smegmatis | M. smegmatis | 2 | Â |
B | M. avium subsp. avium type 2 | M. avium subsp. avium | M. avium complex** | 2 | Â |
D | M. kansasii type 1 | M. kansasii | M. kansasii | 6 | Â |
D | M. kansasii type 2 | M. kansasii | M. kansasii | 1 | Â |
D | M. kansasii type 6 | M. kansasii | M. kansasii | 1 | Â |
D | M. triviale type 1 | M. triviale | M. triviale | 1 | Â |
F | M. malmoense type 1 | M. malmoense | M. malmoense | 2 | Â |
F | M. szulgai type 1 | M. szulgai | M. szulgai | 1 | Â |
F | M. interjectum type 1 | M. interjectum | M. interjectum | 1 | Â |
G | M. intracellulare type 1 | M. intracellulare | M. avium complex** | 14 | Â |
G | M. gordonae type 1 | M. gordonae | M. gordonae | 6 | Â |
G | M. gordonae type 2 | M. gordonae | M. gordonae | 1 | Â |
G | M. gordonae type 5 | M. gordonae | M. gordonae | 1 | Â |
Total | Â | Â | Â | 361 | Â |